基于加權基因共表達網絡分析鑒定調控油菜種子次生休眠候選基因

【摘要】：油菜種子的次生休眠容易導致油菜自生苗發生，影響制種品質和安全。本研究以課題組自主培育的Huaiyou-WSD-H2（次生休眠弱）和Huaiyou-SSD-V1（次生休眠強）品系為材料，利用聚乙二醇（polyethylene glycol,PEG）模擬干旱，誘導種子次生休眠，對次生休眠誘導前、后的油菜種子進行高通量轉錄組測序。利用加權基因共表達網絡分析（weighted gene co-expression network analysis, WGCNA）將高通量轉錄組測序中17 706個高表達基因（FPKM 5）劃分為17個共表達模塊。結合GO/KEGG富集分析和差異表達分析，在與次生休眠極顯著正相關的yellow模塊中篩選到3個與色氨酸代謝相關的基因（BnaC08g25400D、BnaC09g31260D和BnaC09g49740D）在誘導后的強、弱次生休眠材料間存在差異表達，利用qRT-PCR進行驗證，并初步分析了候選基因的調控網絡，為解析依賴色氨酸的生長素生物合成途徑調控油菜種子次生休眠的遺傳基礎提供理論依據。